Projekt Navzkrižja interesov pri rabi podtalnice Trajanje projekta: 1. julij 2004–30. junij 2007 Vodja projekta: dr. Irena Rejec Brancelj
Projekt Ohranitev vodnega življenja v podzemlju Trajanje projekta: 1. januar 2002–31. december 2004 Vodja projekta: dr. Irena Rejec Brancelj
Projekt Integralna obremenjenost prodnih ravnin - primer Ljubljanskega polja Trajanje projekta: 1. julij 2001–30. junij 2004 Vodja projekta: dr. Irena Rejec Brancelj