Projekt Ekološke raziskave evropskih ogroženih vrst metuljev (Lepidoptera) v Sloveniji in na Madžarskem, s poudarkom na vrstah iz seznama NATURA 2000 Trajanje projekta: 3. januar 2005–20. december 2006
Projekt Floristične, ekološke in stukturne spremembe grmiščne vegetacije na prehodu med mediteransko in evrosibirsko regijo Trajanje projekta: 1. januar 2010–31. december 2011
Projekt Ideje o Evropi in evropeizaciji v primerjalni perspektivi: Slovenija in Srbija Trajanje projekta: 1. januar 2012–31. december 2013
Projekt Razvojne usmeritve kmetij v Sloveniji Trajanje projekta: 1. oktober 2011–30. september 2013 Vodja projekta: dr. Andrej Udovč Šifra: V4-1148
Projekt Rodnost in samomorilnost na Slovenskem: multidisciplinarni vidiki Trajanje projekta: 1. november 2001–31. oktober 2004 Vodja projekta: dr. Lilijana Šprah Šifra: V5-0577 (B)
Projekt Hetero in avtoagresivnost v družini Trajanje projekta: 1. januar 2003–31. december 2005 Vodja projekta: dr. Majda Černič Istenič Šifra: V5-0800 (B)
Projekt Odnosi med spoloma in generacijami na kmetijah v Sloveniji Trajanje projekta: 1. oktober 2006–30. september 2008 Vodja projekta: dr. Majda Černič Istenič Šifra: V4-0360 (C)
Projekt Človeški dejavnik v vojaškem sistemu Trajanje projekta: 1. avgust 2004–31. avgust 2006 Vodja projekta: Ljubica Jelušič Šifra: M5-0058
Projekt Kraški sedimenti: orodje za rekonstrukcijo tektonskega in geomorfnega razvoja kraških področij (na zgledih s kraških ozemelj Slovenije) Trajanje projekta: 1. januar 2009–31. december 2010 Vodja projekta: Nadja Zupan Hajna Šifra: BI-UA/09-10-010
Projekt Značilnosti prenosa snovi, ki onesnažujejo kraški vodonosnik ob prelomni coni: primer izvirov Heilongtan, Kunming, Yunnanska planota, Kitajska Trajanje projekta: 1. julij 2009–30. junij 2011 Vodja projekta: dr. Tadej Slabe, Liu Hong Šifra: BI-CN/09-11-010