Program Slovenski jezik v sinhronem in diahronem razvoju Trajanje programa: 1. januar 2004–31. december 2008 Vodja programa: dr. Helena Dobrovoljc Šifra: P6-0038 (B)
Projekt Preobrazba pokrajine Trajanje projekta: 1. oktober 2006–30. april 2008 Vodja projekta: dr. Lučka Ažman Momirski
Program Geografski terminološki slovar Trajanje programa: 1. januar 2003–31. december 2005 Vodja programa: dr. Franc Lovrenčak
Projekt Soška fronta – geografija Trajanje projekta: 1. junij 2006–31. maj 2008 Vodja projekta: dr. Petra Svoljšak
Projekt Bright Future Trajanje projekta: 1. marec 2017–1. marec 2020 Vodja projekta: dr. David Bole Šifra: H6-8284 (B)
Projekt Konstruiranje pajčje mreže preko madagaskarskih rek: nenavadna pajčevina gigantskih mrež Trajanje projekta: 1. januar 2009–31. december 2010 Šifra: 8655-09
Projekt Arheološke in palinološke raziskave na Ljubljanskem barju Trajanje projekta: 1. julij 2004–30. junij 2007 Vodja projekta: dr. Anton Velušček Šifra: J6-6348-0618-04
Projekt Izdelava in demonstracija modela za načrtovanje ohranjanja umetnostnozgodovinske dediščine v vojnih spopadih Trajanje projekta: 1. september 2007–30. november 2009 Vodja projekta: dr. Barbara Murovec
Projekt Umetnostna topografija Slovenije Trajanje projekta: 1. oktober 2006–30. september 2008 Vodja projekta: dr. Blaž Resman
Projekt Slovenska recepcija evropske kulture: Valvasorjeva grafična zbirka Trajanje projekta: 1. oktober 2006–30. september 2008 Vodja projekta: dr. Barbara Murovec