Projekt Stanje in perspektive slovenskega povratništva Trajanje projekta: 1. januar 2000–30. junij 2002
Projekt Neraziskana latinska in nemška književnost v slovenskih deželah v dobi baroka Trajanje projekta: 1. julij 2011–30. junij 2013 Vodja projekta: dr. Luka Vidmar ARIS šifra projekta: Z6-4251 (B)
Projekt Informacijski sistem za arheološko dediščino Slovenije Trajanje projekta: 1. januar 2007–31. december 2009 Vodja projekta: dr. Janez Dular ARIS šifra projekta: J6-9033
Program Literarnozgodovinske, literarnoteoretične in metodološke raziskave Trajanje programa: 1. januar 2004–31. december 2008 Vodja programa: dr. Darko Dolinar ARIS šifra projekta: P6-0024 (A)
Projekt Neznani rokopisi slovenskega slovstva 17. in 18. stoletja Trajanje projekta: 1. februar 2008–30. januar 2011 Vodja projekta: dr. Matija Ogrin ARIS šifra projekta: L6-0163 (B)
Projekt Elektronske znanstvenokritične izdaje in razvoj slovenske ter bolgarske literarne vede Trajanje projekta: 9. november 2011–9. november 2013 Vodja projekta: dr. Matija Ogrin ARIS šifra projekta: BI-BG/11-12-003
Projekt Ocena stanja populacij in habitatov ter predlog monitoringa za ogrožene vrste barjanski okarček (Coenonympha oedippus), močvirski tulipan (Fritillaria meleagris) in Loeselova grezovka (Liparis loeselii) na Ljubljanskem barju Trajanje projekta: 15. maj 2008–30. oktober 2009
Projekt Izvori in transformacije motivov in simbolov v literaturi in jezikih Trajanje projekta: 1. marec 2009–30. november 2012 Vodja projekta: Dr. Irena Avsenik Nabergoj ARIS šifra projekta: J6-2090