Projekt ETNOLOŠKI POGLEDI IN PODOBE (OD 19. DO 21. STOLETJA) Trajanje projekta: 1. januar 2004–30. junij 2007 Šifra: J6-6352 (C)
Projekt Populacijska dinamika ob slovensko-hrvaški meji: primer širšega obkolpskega prostora Trajanje projekta: 1. januar 2004–31. december 2006 Vodja projekta: dr. Duška Knežević Hočevar in dr. Jadranka Grbić Šifra: BI-HR/04-05-002
Projekt PROGRAM: Arheološke raziskave (2004–2008) Trajanje projekta: 1. januar 2004–3. december 2008 Vodja projekta: dr. Slavko Ciglenečki Šifra: P6-0064
Projekt Biomineralizacija in izotopska sestava kisika in ogljika v hišicah nekaterih vrst sladkovodnih in kopenskih polžev v odvisnosti od ekoloških parametrov Trajanje projekta: 1. januar 2004–31. december 2005 Šifra: BI-HR/04-05-021
Projekt Regionalna primerjava spreminjanja poselitvene rabe zemljišč med statističnimi regijami v Sloveniji v obdobju 1991-2002 Trajanje projekta: 1. november 2003–31. oktober 2005 Šifra: CRP V5-0903
Projekt Stanje arhivskega, muzejskega in knjižničnega gradiva pri slovenskih izseljencih na Švedskem in v ZDA ... Trajanje projekta: 1. oktober 2003–30. september 2005
Projekt Vpeljevanje poklicnega svetovanja za begunce in migrante Trajanje projekta: 1. oktober 2003–30. september 2006 Vodja projekta: dr. Pamela M. Clayton Šifra: UK/03/B/F/PP-162_004
Projekt Strokovna izhodišča za vzpostavljanje omrežja Natura 2000: Metulji (Lepidoptera) Trajanje projekta: 1. september 2003–1. september 2004