Projekt Nasilje nad ženskami ali kako doseči ničelno toleranco Trajanje projekta: 1. julij 2003–31. december 2003 Vodja projekta: dr. Majda Černič Istenič
Projekt Zasebni vodnjaki in vrtine v Ljubljani Trajanje projekta: 1. junij 2003–31. januar 2004 Vodja projekta: dr. Aleš Smrekar
Projekt Nacionalne literature, Srednja Evropa, Evropa in svet: metodološki problemi primerjalne literarne vede z vidika slovensko-čeških razmerij Trajanje projekta: 1. maj 2003–1. maj 2005 Vodja projekta: Ivo Pospíšil (Masarykova univerza, Brno) Šifra: BI-CZ/04-05-005
Projekt Veliki šolski atlas Trajanje projekta: 1. marec 2003–15. april 2003 Vodja projekta: dr. Drago Kladnik
Program Atlant Trajanje programa: 1. januar 2003–31. december 2005 Vodja programa: dr. Milan Orožen Adamič
Program Geografski terminološki slovar Trajanje programa: 1. januar 2003–31. december 2005 Vodja programa: dr. Franc Lovrenčak
Projekt Glasba cerkvenih redov na Slovenskem od 16. stoletja do njihove ukinitve Trajanje projekta: 1. januar 2003–31. december 2005 Šifra: J6-5075
Projekt Zemljevid Slovenije v merilu 1 : 250.000 Trajanje projekta: 1. januar 2003–31. december 2008 Vodja projekta: mag. Borut Peršolja (2003-2004), dr. Drago Kladnik (2005-2008)
Projekt ACUME – Kulturni spomin v evropskih državah: meddisciplinarni pristop Trajanje projekta: 1. januar 2003–31. oktober 2006 Vodja projekta: Vita Fortunati
Projekt Pravičnost v izobraževalnih sistemih – primerjalni vidik Trajanje projekta: 1. januar 2003–31. december 2005 Vodja projekta: M. Peček Čuk